特許人將經營資源授予被特許人之后，會對被特許人的經營行為進行約束和管理，其目的之一就是強化對經營資源的保護。通常，被特許人應從以下兩個方面保護特許經營資源:

一方面，特許經營資源一定有特許經營項目的經營秘密，因此，被特許人不僅應當保守而不泄露經營秘密，而且應采取必要的措施防止經營秘密被他人竊取。被特許人通常采取的保密措施包括:與員工簽訂保密協議、對配方與訣竅等秘密限定知悉人群、對保密場所限制進入、對秘密文件進行加密管理等。

另一方面，被特許人在經營特許經營資源的過程中，可以對經營資源進行創新，以維持市場競爭優勢;可以將消費者的投訴建議反饋給特許人，為特許人優化經營資源提供市場信息;還可以在征得特許人同意的前提下，對特許經營資源進行本土化改造，這些措施都有助于被特許人保護經營資源的價值。